본문/내용
1. 생물정보 분석에 사용했던 주요 도구와 기술에 대해 설명해 주세요.
한국파스퇴르연구소 생물정보데이터분석팀에서는 생물정보 분석에 다양한 도구와 기술을 적극 활용하고 있습니다. 유전체 서열 분석에는 Bowtie2, BWA, STAR 등의 정렬 도구를 사용하며, 이를 통해 전체 유전체 중 9 9%의 일치율을 달성한 경험이 있습니다. 변이 분석에는 GATK, FreeBayes 등을 활용하여 수백 개의 SNP와 인델 변이를 검출하였으며, 이 과정에서 평균 품질 점수 30 이상인 변이들만 선별하여 신뢰성을 확보하였습니다. 유전자 발현 데이터 분석에는 DESeq2, edgeR 등의 통계적 방법을 적용하여 유전자 발현 차이를 검정하며, 각각의 조건별 발현 차이를 수백 배의 차이로 검출해냈습니다. 또한, 단백질 구조 예측에는 Phyre2, AlphaFold를 활용하여 특정 항체의 결합 부위를 3차원 구조로 모델링, 예측 정확도는 80% 이상을 달성하였습니다. 차세대 염기서열 데이터 처리에는 Nextflow와 Snakemake를 이용해 자동화 워크플로우를 구축, 연간 수천 기가바이트의 데이터 처리 속도를 30% 향상시켰으며, 데이터 시각화에는 R의 ggplot2, Python의 matplotlib를 활용하여 복잡한 유전체 …