전기영동 SDS sample loading buffer를 사용하는 이유, running gel에서 단백질 분리가 일어나는 원리

1. SDS-PAGE 개요

전기영동 SDS-PAGE는 단백질의 크기와 분자량에 따라 분리하는 방법이다. 이 방법은 전기장을 이용하여 전하를 부여받은 단백질이 겔 내부를 이동하면서 크기별로 분리되는 원리를 기반으로 한다. SDS-PAGE의 핵심 원리는 SDS(Sodium Dodecyl Sulfate)라는 계면활성제를 이용하여 단백질의 구조를 변성시키고, 음전하를 띠게 하여 분리 과정을 표준화하는 것이다. SDS는 단백질에 결합하여 1:1의 몰수로 결합되며, 단백질의 3차원 구조를 해체시키고 선형 사슬로 만든다. 이로 인해 단백질의 전하와 크기에 따른 이동 속도 차이만이 분리의 기준이 되며, 전단력과 같은 구조적 요인들은 제거된다. SDS-PAGE는 전기적인 힘에 의해 단백질이 젤 내부에서 이동하면서 크기에 따라 분리되는 원리이다. 이때 전기장은 일반적으로 100~200V 범위에서 설정하며, 단백질은 음전하를 띠기 때문에 양극 쪽으로 이동한다. 젤은 일반적으로 아가로오스 또는 폴리아크릴아미드로 만들어지며, 겔의 농도에 따라 분리 가능한 크기 범위가 달라진다. 예를 들어, 12% 폴리아크릴아미드 겔은 약 10~70 kDa 사이의 단백질 분리 능력을 갖는다. 전기영동 후, 단백질은 겔 내의…