[생화학] [생화학]SDS-PAGE

1. SDS-PAGE의 원리

SDS-PAGE는 단백질 분리와 분석에 널리 사용되는 실험 기법이다. 이 방법은 단백질의 분자량에 따른 분리를 가능하게 하는데, 주로 SDS (Sodium Dodecyl Sulfate)와 폴리아크릴아미드 겔을 이용한다. SDS는 음이온성 계면활성제이며, 단백질의 구조를 변성시키는 역할을 한다. 이물질이 단백질의 3차원 구조를 해체하고, 단백질의 펩타이드 결합을 끊어, 모든 단백질이 길이 방향으로 펼쳐진 선형 상태로 만들어진다. 이때 SDS는 단백질의 아미노산 수와 무관하게 일정한 음전하를 부여하여, 단백질이 크기와 형태에 의해서만 이동하게 만든다. 폴리아크릴아미드 겔은 망상구조를 가지고 있으며, 크기별로 단백질이 분리되도록 조절된 매우 미세한 망상 구조를 갖춘다. 전기 영동 과정에서는 일정한 전압이 인가되며, SDS로 처리된 단백질은 네거티브 전하를 띄고 있어 겔 내에서 양극(+)쪽으로 이동한다. 단백질의 크기가 작을수록 겔 내를 빠르게 이동하며, 크기가 클수록 느리게 이동하는 특성을 이용하여 분리한다. 이러한 원리 덕분에 동일한 조건에서 다양한 단백질 샘플들을 크기별로 구분할 수 있다. 실험에서는 보통 크기가 10~200 kDa인 단백…