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헌재 결정에 따라 정부는 국민의 의사를 무시하고 정치적 목적에 따라 무리하게 수도 이전을 추진하려 했다는 비판을 면하기 어렵게 됐다.
또 국민 사이에 갈등의 씨앗이 되고 있는 국가보안법 폐지와 언론개혁법 등 4대 개혁 입법 추진에도 영향이 클 것으로 보인다.
2. 수도이전 위헌 결정에 대한 반대 시각
헌재의 결정에 대해 반대하고 있는 그룹의 시각은 위헌 결정에 대해 특별법우선의원칙과 신법우선의원칙에 반한다고 말한다. 즉, 서울이 수도라는 사실은 헌법이 아니라 서울특별시 행정특례에 관한 법률 제2조에 명시되어 있다고 보고 동법률을 보면 ‘서울특별시는 정부의 직할에 두되, 이 법이 정하는 범위 안에서 수도로서의 특수한 지위를 가진다’고 규정하고 있는바, 이는 서울이 수도임을 법률로서 규정하고 있는 것으로 반대하고 있다.
반대측 의견은 행정수도 이전에 관한 법률은 동법의 특별법 내지는 신법으로서 서울특별시행정 특례에 관한법률 2조에 우선하는 효력을 지닌 것이 명백함에도, 헌법재판소는 이러한 법률해석상의 대원칙을 무시하여 결정을 내린 것으로서 그 자체로서 위헌의 소지가 있다는 것이다.
첫째, 헌재의 결정은 특별…