DNA Chip

DNA chip의 종류 §DNA chip 제작 방법에 의한 분류 DNA chip은 제작 방법에 따라 크게 4 가지로 나눌 수 있다. 이들의 특징은 다음과 같다. §Microarray chip. Microarray chip은 1995년 미국 stanford 대학의 생화학과에서 만들어 졌으며약 2-3천개의 유전자가 약 1 cm2 안에 붙어 있다.처음에는 유전자 발현 측정 목적으로 cDNA를 붙여 놓은 chip을 만들었기 때문에 cDNA microarray chip이라 불렸지만 지금은 돌연변이를 검색할 수 있도록 oligonucleotide를 같은 방법으로 붙인 chip도 개발되었다. 그러면 어떻게 cDNA microarray chip을 만드는지 yeast를 예로 해서 알아보면, 먼저 yeast의 모든 염기서열이 밝혀졌기 때문에 이것으로부터 모든 가능한 유전자(open leading frame)들의 위치를 파악한다. 각각 확인된 유전자들의 시작과 끝 부분에 PCR을 하기 위해 필요한 연기들인 primer를 컴퓨터에 의해 찾아낸다. 즉 6,100 개의 모든 yeast 유전자를 PCR 하기 위해서는 12,200개의 다른 primer들이 필요한 것이다. 이들 primer들은 서로 비슷한 결합 온도(annealing temperature)를 가지고 있어서 동시에 여러 유전자를 PCR 할 수 있어야 한다. 이렇게 설정된 primer들은 stanford 대학에서 만든 96-well oligonucleotide synthersizer로 합성 되게 된다. 이 기계를 사용하면 96개의 다른 oligonucleotide를 2…
그러면 어떻게 cDNA microarray chip을 만드는지 yeast를 예로 해서 알아보면, 먼저 yeast의 모든 염기서열이 밝혀졌기 때문에 이것으로부터 모든 가능한 유전자(open leading frame)들의 위치를 파악한…