º»¹®/³»¿ë
_SLIDE_1_
Agarose gel electrophoresis£¦ Gel elution
_SLIDE_2_
Àü±â¿µµ¿
¿ë¾×¿¡ Àü·ù¸¦ ÅëÇßÀ» ¶§ ¿ë¾× ÁßÀÇ ÇÏÀü ÀÔÀÚ°¡ ¾ç±Ø ¶Ç´Â À½±ØÀ¸·Î À̵¿ÇÏ´Â Çö»ó
ÁÖ·Î ´Ü¹éÁú °ü·Ã ¹°Áú ¶Ç´Â À¯»çÇÑ ¼ºÁúÀ» °¡Áø ¹°ÁúÀÌ ´ë»ó
À̵¿ÀÇ ¿ø¸®
DNAÀÚü°¡ ÀüüÀûÀ¸·Î (-)ÀüÇϸ¦ ¶ç°í ÀÖ´Â °ÍÀ» ÀÌ¿ëÇÑ °Í
½Ã°£ÀÌ Áö³¯¼ö·Ï sizeº°·Î ¿òÁ÷ÀÎ °Å¸® Â÷À̰¡ ³ª´Â ¿ø¸® ÀÌ¿ë
_SLIDE_3_
Àü±â¿µµ¿¹ýÀÇ Á¾·ù
À̵¿ °è¸é Àü±â¿µµ¿ (moving-boundary electrophoresis)
¶ì Àü±â¿µµ¿ (zone electrophoresis)
Á¾ÀÌ Àü±â¿µµ¿
ÆòÆÇ °Ö Àü±â¿µµ¿[polyacrylamide, agarose]
¸é¿ª Àü±â¿µµ¿
ÀüºÐ-°Ö Àü±â¿µµ¿
¿øÆÇ Àü±â¿µµ¿
SDS polyacrylamide Àü±â¿µµ¿
_SLIDE_4_
Gel electrophoresis(Á© Àü±â ¿µµ¿¹ý)
Gel matrix¿¡ Àü·ù¸¦ Èê·Áº¸³» DNA, RNA, ´Ü¹éÁú µîÀ» ºÐ¸®ÇÏ´Â ¹æ¹ý
Gel¿¡ µû¸¥ Â÷ÀÌ
: Agarose gel / DNA¿Í RNA band
: SDS-PAGE, 2D-gel Àü±â¿µµ¿ / ´Ü¹éÁú band
_SLIDE_5_
ÆòÆÇ °Ö Àü±â¿µµ¿
Æò¡¦(»ý·«)
1.2
2.0
3. EtBr binding À¯¹«
4. Agarose gelÀÇ EEO
¨ç ±ú²ýÇÏ°í °ÇÁ¶ÇÑ À¯¸®ÆÇ(¶Ç´Â Àü±â¿µµ¿ ±â±¸¿¡ ²À ¸Â°Ô ¸¸µé¾îÁø ÇÃ¶ó½ºÆ½ÆÇ) »ç¹æ ¸ð¼¸®¸¦ ÁÖÇüÀÇ ¸ð¾çÀÌ µÇµµ·Ï Å×ÀÌÇÁ·Î °¨Àº ÈÄ ¼öÆòÀ¸·Î ¸ÂÃß¾îÁø ÆÇ À§¿¡ ÁÖÇüÀ» µÐ´Ù.
¨è Àü±â¿µµ¿ tank¸¦ ä¿ì°í gel Á¦Á¶¿¡ ÀÌ¿ëÇϱâ À§ÇÑ Àü±â¿µµ¿ ¿ÏÃæ¿ë¾×(1x TAE)À» ÃæºÐÈ÷ ÁغñÇÑ´Ù. ºÐ¸®ÇϰíÀÚ ÇÏ´Â DNA Å©±â¿¡ ÇØ´çÇÏ´Â ¾çÀÇ agarose ºÐ¸»°ú ¿ÏÃæ¾×À» »ï°¢ Çöó½ºÅ© ¶Ç´Â À¯¸®º´¿¡ ´ã´Â´Ù.
¨é Microwave oven¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ¿© agarose°¡ ³ìÀ» ¶§±îÁö ¼¼È÷ °¡¿ÇÑ´Ù.
¨ê ¿ë¾×À» 60¡ÆC±îÁö ½ÄÈù´Ù. ÇÊ¿äÇϸé ethidium bromide¸¦ ÃÖÁ¾³óµµ 0.5 ¥ìg/mlÀÌ µÇµµ·Ï °¡Çϰí Àß È¥ÇÕÇÑ´Ù.
¨ë agarose¸¦ ¸ðµÎ ºÎ¾úÀ» ¶§ ÁÖÇüÀÇ ¹Ø¹Ù´ÚÀ¸·ÎºÎÅÍ 0.5¢¦1.0 mmÁ¤µµ ¶³¾îÁ®¼ À§Ä¡ÇÏ¿© ȨÀ» Çü¼ºÇÒ ¼ö ÀÖµµ·Ï comb¸¦ °íÁ¤½ÃŲ´Ù.
¨ì µû¶æÇÑ agarose ¿ë¾×À» ÁÖÇü¿¡ º×´Â´Ù. GelÀº 3¢¦5 mm µÎ²²°¡ µÇµµ·Ï ÇÏ°í ±âÆ÷°¡ »ý±âÁö ¾Êµµ·Ï ÁÖÀÇÇÑ´Ù.
¨í ½Ç¿Â¿¡¼ 20¢¦30ºÐ µÎ¾î gelÀÌ ¿ÏÀüÈ÷ ±»Àº ÈÄ comb°ú Å×ÀÌÇÁ¸¦ Á¶½É½º·´°Ô Á¦°ÅÇÑ ´ÙÀ½ gelÀ» Àü±â¿µµ¿ tank¾È¿¡ ¼³Ä¡ÇÑ´Ù.
5. QiAquick column
¹Ø¹Ù´ÚÀ¸·ÎºÎÅÍ 0.5¢¦1.0 mmÁ¤µµ ¶³¾îÁ®¼ À§Ä¡ÇÏ¿© ȨÀ» Çü¼ºÇÒ ¼ö ÀÖµµ·Ï comb¸¦ °íÁ¤½ÃŲ´Ù.
¨ì µû¶æÇÑ agarose ¿ë¾×À» ÁÖÇü¿¡ º×´Â´Ù. GelÀº 3¢¦5 mm µÎ²²°¡ µÇµµ·Ï ÇÏ°í ±âÆ÷°¡ »ý±âÁö ¾Êµµ·Ï ÁÖÀÇÇÑ´Ù.
¨í ½Ç¿Â¿¡¼ 20¢¦30ºÐ µÎ¾î gelÀÌ ¿ÏÀüÈ÷ ±»Àº ÈÄ comb°ú Å×ÀÌÇÁ¸¦ Á¶½É½º·´°Ô Á¦°ÅÇÑ ´ÙÀ½ gelÀ» Àü±â¿µµ¿ tank¾È¿¡ ¼³Ä¡ÇÑ´Ù.
_SLIDE_13_
Agarose gel Àü±â¿µµ¿
_SLIDE_14_
Buffers
TAE (Tris/Acetate/EDTA):ºñ±³Àû ±ä DNA¸¦ Àü±â¿µµ¿½Ã »ç¿ë
TBE (Tris/Borate/EDTA): ªÀº Å©±âÀÇ DNA¸¦ Àü±â¿µµ¿½Ã »ç¿ë
_SLIDE_15_
Gel elution
DNA Àü±â¿µµ¿ ÈÄ ¿øÇÏ´Â band¸¦ gel·ÎºÎÅÍ ºÐ¸®
ÀçÁ¶ÇÕ DNA¸¦ ¸¸µé ¶§ ¾²ÀÌ´Â ±â¼ú
ȸ¼öÀ²°ú ¿ëÃâµÈ DNAÀÇ ¼ø¼öµµ°¡ ³ô°í,Á» ´õ ºü¸£°í, °£ÆíÇÑ DNA ȸ¼ö¹æ¹ý °è¼Ó °³¹ß Áß
_SLIDE_16_
Gel elution ½ÇÇè ¹æ¹ý
GeneÀ» Ưº°ÇÑ primer¿Í ÇÔ²² PCR·Î ÁõÆø
Gel electrophoresis
Àü±â¿µµ¿ µÈ DNA¸¦ cutting ¡°Elution¡±
CuttingµÈ gel¿¡¼ DNA¸¦ ¼ø¼öÇÏ°Ô È¸¼ö
ÀϺθ¦ ´Ù½Ã Gel electrophoresis
³²Àº DNAÁß ÁõÆø½Ã۰íÀÚ ÇÏ´Â ºÎºÐÀ» Á¦ÇÑÈ¿¼Ò·Î Àß¶ó³¿
_SLIDE_17_
Gel Elution ½ÇÇè¹æ¹ý
Agarose gel·ÎºÎÅÍ DNA fragment¸¦ ÀÚ¸¥´Ù.
2. 1.5ml microcentrifuge tube ¿¡ gel slice¸¦ ³Ö¾î ¹«°Ô¸¦ Àç°í QG buffer¸¦ gel ¹«°ÔÀÇ 3¹è¸¸Å ÷°¡.
3. 50µµ¿¡¼ 10min incubate, incubation µ¿¾È ¸Å 2~3ºÐ¸¶´Ù vortexing ÇÏ¸é¼ mix
4. Sample¿¡ gel volumeÀÇ µ¿·ÉÀ¸·Î iso-propanol ÷°¡ & mix
5. QiAquick column