[사회과학] 분자생물학 Polymerase Chain Reaction[PCR]에 대해서

이기 때 문에 합성되는 DNA 영역은 프라이머에 의해 결정되어진 특정된 영역이고, 이 영역만이 증폭되어 진다. 프라이머 DNA는 주형 DNA 가닥(역가닥)의 특정 영역 염기서열을 가지고 있고, 그 3`-OH 말단이 다른 프라이머의 방향으로 행하고 있다. DNA 중합효소는 합성반응을 개시할 때에 프라이 머를 필요로 한다. 프라이머는 dNTP의 존재, 특이적인 pH 조건하에서 각각의 프라이머 3`-말단 에 dNMP를 부가시키는 방식으로 반응이 진행된다.
반응에 첨가된 주형 DNA의 양과 증폭된 DNA 절편의 양은 비슷하거나 증폭된 DNA의 양이 적 을 수도 있지만 전기영동을 하면 보이는 것은 증폭된 DNA뿐이다. 사람의 genome은 30억 개의 염기쌍으로 이루어져 비록 그 양이 많아도 많은 수의 절편에 분산되어 있거나 혹은 아예 큰 덩어 리이어서 분리되지 않는 반면 증폭된 절편은 고작해야 수백 염기쌍 밖에 안되고 그 개수가 매우 많으며 겔의 한 군데에 집중되기 때문이다.
생체 내에서 DNA가 복제될 때에는 잘못된 염기를 취하게 될 확률이 1/109 정도로 매우 낮으나 PCR의 경우에는 1/104로 상당히 높은 값을 나타낸다. 따라서 예를 들어 1kb길이의 DNA 단편을 증폭하는 경우에는 10개의 DNA 단편 중 어느 하나의 염기가 잘못될 가능성이 있으며 20개의 DNA 단편 중에서는 두 군데가 잘못될 수 있다. PCR에 의해 증폭시킨 DNA를 사용하여 직접적으 로 염기서열을 결정하는 경우에는 그러한 잘못된 염기는 사실상 문제가 되지 않는다. 특히 PCR의 출발시에 DNA의 분자수가 100개 이상인 경우에는 어느 곳의 염기에 실수가 일어난다 하더라도 다른 99% 이상의 분자 대부분에서 동일한 위치의 염기에 실수가 생길 가능성은 사실상 없으므로 증폭된 DNA 집단의 염기서열 결정의 결과에는 영향이 없다. 단지 아주 미량의 DNA, 특히 만약 한 분자만으로 시작하여 증폭시킨 경우에는 제 1사이클에서 일어난 실수는 분자집단의 1/4에서 그 위치의 염기가 잘못되게

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